Команды

Создание первой (пустой) миграции

alembic revision -m "Empty Init"

Обновление базы данных до текущей версии

alembic upgrade head

Автогенерация миграции

alembic revision --autogenerate -m "Added Cookie model"

Поддерживаемые и неподдерживаемые действия при автоматической миграции

Тип элемента	Поддерживаемые	Неподдерживаемые
Таблицы	Добавление и удаление	Изменение имени
Столбец	Добавление, удаление, изменение нулевого статуса на столбце	Изменение имени
Индекс	Основные изменения в индексах и явно обозначенных уникальных ограничениях, поддержка автоматической генерации индексов и уникальных ограничений
Ограничения		Ограничения без явного имени
Ключи	Переименование
Типы		Типы, которые явно не поддерживаются базой данных

Ручное создание миграций

На примере изменения имени таблицы

alembic revision -m "Renaming table"

def upgrade():
    op.rename_table('old_name', 'new_name')
def downgrade():
    op.rename_table('new_name', 'old_name')

alembic upgrade head